口服避孕药使用方便，但也存在一些副作用，经常服用者容易导致骨质疏松。
但是，研究人员认为，口服避孕药对育龄妇女有诸多好处，她们并不需要因此而“因噎废食”停服避孕药。尤其是服用短效避孕药，能使月经规律，减低宫外孕和卵巢癌发生。为预防或减轻骨质疏松，女性可以通过食物或药物来补钙。
口服避孕药导致骨质酥松的原因是，口服避孕药的主要成分是人工合成的雌孕激素复合制剂，无论是短效的还是长效的口服避孕药，长期服用都会影响钙质代谢吸收，增加患骨质疏松的风险。服用口服避孕药的女性平均颈椎骨密度比不服用的女性低5.9%，其全身平均骨密度比不服用的女性低2.3%，其髋部的骨密度数据也偏低。
